硅藻土化学成份主要是SiO2，并含有少量Fe2O3、CaO、MgO、Al2O3、K2O、Na2O、P2O5及有机杂质。SiO2通常占80%以上，高可达94%。硅藻土的氧化铁含量一般为1~1.5%，氧化铝含量为3~6%。

　　硅藻土通常呈浅黄色或浅灰色，质软，多孔而轻，吸水性和渗透性强。工业上常用来作为保温材料、过滤材料、填料、研磨材料、水玻璃原料、脱色剂及催化剂载体等。显微镜下可观察到天然硅藻土的特殊多孔性构造，这种微孔结构是硅藻土具有特征理化性质的原因。

　　天然硅藻土的主要成分是SiO2，者色白，SiO2含量常超过70%。单体硅藻无色透明，硅藻土的颜色取决于粘土矿物及有机质等，不同矿源硅藻上的成分不同.